Protein–RNA interactions for Protein: O14782

KIF3C, Kinesin-like protein KIF3C, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3CO14782 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF3CO14782 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF3CO14782 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms