Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
J3KT08 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
J3KT08 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
J3KT08 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
J3KT08 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
J3KT08 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
J3KT08 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
J3KT08 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
J3KT08 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
J3KT08 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
J3KT08 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
J3KT08 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
J3KT08 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
J3KT08 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
J3KT08 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
J3KT08 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
J3KT08 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
J3KT08 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
J3KT08 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms