Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU7

ACAD8, Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD8Q9UKU7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACAD8Q9UKU7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms