Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms