Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms