Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCND1Q9NSA2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms