Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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