Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CALN1Q9BXU9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALN1Q9BXU9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms