Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms