Protein–RNA interactions for Protein: Q99259

GAD1, Glutamate decarboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAD1Q99259 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAD1Q99259 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAD1Q99259 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms