Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms