Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRELID3AQ96N28 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRELID3AQ96N28 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PRELID3AQ96N28 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms