Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms