Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms