Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CSRNP3Q8WYN3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSRNP3Q8WYN3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSRNP3Q8WYN3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSRNP3Q8WYN3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSRNP3Q8WYN3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSRNP3Q8WYN3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSRNP3Q8WYN3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSRNP3Q8WYN3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSRNP3Q8WYN3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSRNP3Q8WYN3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CSRNP3Q8WYN3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CSRNP3Q8WYN3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CSRNP3Q8WYN3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms