Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms