Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms