Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME8Q8N427 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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