Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms