Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms