Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM78Q5T7P6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms