Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCOLCEQ15113 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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