Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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