Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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