Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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