Protein–RNA interactions for Protein: Q05315

CLC, Galectin-10, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCQ05315 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLCQ05315 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLCQ05315 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLCQ05315 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLCQ05315 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLCQ05315 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLCQ05315 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLCQ05315 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLCQ05315 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLCQ05315 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLCQ05315 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLCQ05315 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLCQ05315 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLCQ05315 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLCQ05315 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLCQ05315 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLCQ05315 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLCQ05315 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLCQ05315 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLCQ05315 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLCQ05315 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLCQ05315 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLCQ05315 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLCQ05315 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLCQ05315 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLCQ05315 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms