Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAG2P55895 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAG2P55895 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAG2P55895 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAG2P55895 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAG2P55895 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAG2P55895 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAG2P55895 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAG2P55895 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAG2P55895 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAG2P55895 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAG2P55895 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RAG2P55895 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAG2P55895 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAG2P55895 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAG2P55895 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAG2P55895 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAG2P55895 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAG2P55895 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAG2P55895 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms