Protein–RNA interactions for Protein: P51911

CNN1, Calponin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN1P51911 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNN1P51911 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNN1P51911 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNN1P51911 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNN1P51911 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms