Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB27AP51159 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms