Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB1P20700 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms