Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGCP20142 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGCP20142 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGCP20142 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGCP20142 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGCP20142 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGCP20142 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGCP20142 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGCP20142 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGCP20142 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGCP20142 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGCP20142 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGCP20142 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGCP20142 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGCP20142 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGCP20142 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGCP20142 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGCP20142 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGCP20142 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGCP20142 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGCP20142 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGCP20142 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGCP20142 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGCP20142 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PGCP20142 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGCP20142 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PGCP20142 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGCP20142 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms