Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC192P0DO97 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms