Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFMP07197 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFMP07197 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEFMP07197 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEFMP07197 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEFMP07197 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEFMP07197 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEFMP07197 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEFMP07197 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEFMP07197 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEFMP07197 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEFMP07197 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEFMP07197 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFMP07197 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFMP07197 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFMP07197 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFMP07197 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFMP07197 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFMP07197 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFMP07197 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFMP07197 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFMP07197 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFMP07197 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFMP07197 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFMP07197 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFMP07197 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFMP07197 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFMP07197 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFMP07197 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFMP07197 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFMP07197 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFMP07197 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFMP07197 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFMP07197 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFMP07197 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFMP07197 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFMP07197 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFMP07197 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFMP07197 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFMP07197 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFMP07197 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFMP07197 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFMP07197 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFMP07197 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFMP07197 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFMP07197 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms