Protein–RNA interactions for Protein: P06730

EIF4E, Eukaryotic translation initiation factor 4E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EP06730 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EIF4EP06730 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms