Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC3P02656 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC3P02656 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC3P02656 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC3P02656 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC3P02656 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC3P02656 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC3P02656 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC3P02656 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC3P02656 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC3P02656 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC3P02656 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC3P02656 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC3P02656 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC3P02656 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC3P02656 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC3P02656 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC3P02656 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC3P02656 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC3P02656 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOC3P02656 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC3P02656 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC3P02656 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC3P02656 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC3P02656 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC3P02656 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC3P02656 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC3P02656 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC3P02656 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC3P02656 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC3P02656 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC3P02656 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC3P02656 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC3P02656 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC3P02656 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC3P02656 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC3P02656 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC3P02656 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC3P02656 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC3P02656 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC3P02656 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC3P02656 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC3P02656 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC3P02656 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms