Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOA1P02647 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOA1P02647 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOA1P02647 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms