Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTA1P02549 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTA1P02549 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms