Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA2O75334 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms