Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SERPINF1-202ENST00000570731 459 ntTSL 511.04□□□□□ -0.644e-17■■■■□ 21.4
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PRPF4O43172 RAB11FIP3-206ENST00000452814 804 ntTSL 514.93□□□□□ -0.027e-8■■■■□ 21.4
PRPF4O43172 RAB11FIP3-202ENST00000412256 558 ntTSL 213.25□□□□□ -0.297e-8■■■■□ 21.4
PRPF4O43172 RAB11FIP3-211ENST00000495663 529 ntTSL 29.7□□□□□ -0.867e-8■■■■□ 21.4
PRPF4O43172 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.459e-7■■■■□ 21.4
PRPF4O43172 NDST1-204ENST00000519157 576 ntTSL 519.03■□□□□ 0.646e-8■■■■□ 21.4
PRPF4O43172 L3MBTL4-208ENST00000583809 549 ntTSL 421.74■■□□□ 1.071e-18■■■■□ 21.4
PRPF4O43172 L3MBTL4-205ENST00000580162 457 ntTSL 316.6■□□□□ 0.251e-18■■■■□ 21.4
PRPF4O43172 L3MBTL4-206ENST00000581231 568 ntTSL 510.99□□□□□ -0.651e-18■■■■□ 21.4
PRPF4O43172 L3MBTL4-204ENST00000578677 521 ntTSL 49.51□□□□□ -0.891e-18■■■■□ 21.4
PRPF4O43172 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.032e-6■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 ATP11C-209ENST00000485626 643 ntTSL 55.62□□□□□ -1.512e-6■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.372e-6■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 C11orf95-201ENST00000338498 723 ntTSL 1 (best)20.8■□□□□ 0.922e-6■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.064e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 SLC25A39-205ENST00000585636 561 ntTSL 221.68■■□□□ 1.064e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 SLC25A39-206ENST00000585695 1121 ntTSL 221.68■■□□□ 1.064e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.894e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 SLC25A39-216ENST00000592857 837 ntTSL 320.02■□□□□ 0.84e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.744e-7■■■■□ 21.3
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PRPF4O43172 SLC25A39-209ENST00000588049 839 ntTSL 518.57■□□□□ 0.564e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.54e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 SLC25A39-208ENST00000586633 566 ntTSL 316.76■□□□□ 0.274e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.054e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 SLC25A39-214ENST00000591151 636 ntTSL 213.7□□□□□ -0.224e-7■■■■□ 21.3
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PRPF4O43172 WTAP-202ENST00000358372 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.612e-8■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 RHBG-208ENST00000620376 1984 ntTSL 222.3■■□□□ 1.168e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 RHBG-201ENST00000451864 1927 ntTSL 221.51■■□□□ 1.038e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 RHBG-205ENST00000612897 1862 ntTSL 1 (best)17.95■□□□□ 0.468e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.418e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 RHBG-207ENST00000618120 2424 ntTSL 214.05□□□□□ -0.168e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 RHBG-206ENST00000613460 1912 ntTSL 1 (best)14□□□□□ -0.178e-7■■■■□ 21.3
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PRPF4O43172 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.544e-7■■■■□ 21.3
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PRPF4O43172 NFRKB-207ENST00000530278 895 ntTSL 320.88■□□□□ 0.931e-12■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.299e-7■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.15e-6■■■■□ 21.3
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PRPF4O43172 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 PPIL2-205ENST00000446951 1926 ntTSL 1 (best)15□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 21.3
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PRPF4O43172 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.084e-7■■■■□ 21.3
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PRPF4O43172 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.249e-8■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.249e-8■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.19e-8■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.119e-8■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 MTHFSD-213ENST00000566050 1270 ntTSL 1 (best)13.28□□□□□ -0.289e-8■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.39e-8■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 MTHFSD-205ENST00000561522 543 ntTSL 411.29□□□□□ -0.69e-8■■■■□ 21.3
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PRPF4O43172 MTHFSD-218ENST00000569000 573 ntTSL 47.8□□□□□ -1.169e-8■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 MTHFSD-216ENST00000568037 845 ntTSL 55.22□□□□□ -1.579e-8■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 EIF4A1-219ENST00000581770 447 ntTSL 213.19□□□□□ -0.34e-11■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 EIF4A1-205ENST00000577738 531 ntTSL 212.31□□□□□ -0.444e-11■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 KLF13-206ENST00000558921 440 ntTSL 325.25■■□□□ 1.631e-6■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.81e-6■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 PATJ-207ENST00000484562 5448 ntTSL 1 (best)11.54□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 PATJ-214ENST00000635023 5242 ntTSL 59.99□□□□□ -0.811e-6■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 PATJ-216ENST00000635214 4863 ntTSL 1 (best)9.02□□□□□ -0.971e-6■■■■□ 21.3
PRPF4O43172 PATJ-204ENST00000459752 5349 ntTSL 1 (best)9.01□□□□□ -0.971e-6■■■■□ 21.3
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