Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP290O15078 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP290O15078 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP290O15078 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP290O15078 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP290O15078 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP290O15078 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP290O15078 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP290O15078 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP290O15078 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP290O15078 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP290O15078 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP290O15078 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP290O15078 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP290O15078 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP290O15078 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP290O15078 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP290O15078 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP290O15078 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP290O15078 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP290O15078 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP290O15078 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP290O15078 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP290O15078 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP290O15078 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP290O15078 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP290O15078 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP290O15078 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP290O15078 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP290O15078 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP290O15078 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP290O15078 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP290O15078 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP290O15078 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP290O15078 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP290O15078 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP290O15078 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP290O15078 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP290O15078 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP290O15078 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP290O15078 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP290O15078 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP290O15078 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP290O15078 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP290O15078 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP290O15078 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP290O15078 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP290O15078 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP290O15078 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP290O15078 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP290O15078 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP290O15078 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP290O15078 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP290O15078 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP290O15078 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP290O15078 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP290O15078 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP290O15078 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP290O15078 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP290O15078 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP290O15078 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP290O15078 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP290O15078 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP290O15078 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP290O15078 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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