Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXLO00592 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXLO00592 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXLO00592 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXLO00592 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXLO00592 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXLO00592 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXLO00592 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXLO00592 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXLO00592 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXLO00592 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXLO00592 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PODXLO00592 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PODXLO00592 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PODXLO00592 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PODXLO00592 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PODXLO00592 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXLO00592 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXLO00592 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXLO00592 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXLO00592 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXLO00592 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXLO00592 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXLO00592 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXLO00592 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXLO00592 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXLO00592 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXLO00592 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXLO00592 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXLO00592 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXLO00592 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXLO00592 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXLO00592 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXLO00592 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXLO00592 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXLO00592 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXLO00592 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXLO00592 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXLO00592 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXLO00592 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXLO00592 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXLO00592 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXLO00592 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXLO00592 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXLO00592 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXLO00592 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXLO00592 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXLO00592 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXLO00592 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXLO00592 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXLO00592 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXLO00592 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXLO00592 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXLO00592 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXLO00592 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXLO00592 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXLO00592 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXLO00592 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXLO00592 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXLO00592 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXLO00592 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXLO00592 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXLO00592 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXLO00592 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXLO00592 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXLO00592 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms