Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP27XA6NNY8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP27XA6NNY8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms