Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POTEB3A0JP26 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEB3A0JP26 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEB3A0JP26 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEB3A0JP26 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEB3A0JP26 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEB3A0JP26 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEB3A0JP26 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEB3A0JP26 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEB3A0JP26 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEB3A0JP26 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms