Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA3Q9Y6H8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms