Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms