Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms