Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms