Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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FAM53CQ9NYF3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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FAM53CQ9NYF3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM53CQ9NYF3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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FAM53CQ9NYF3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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FAM53CQ9NYF3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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FAM53CQ9NYF3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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FAM53CQ9NYF3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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FAM53CQ9NYF3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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FAM53CQ9NYF3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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FAM53CQ9NYF3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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FAM53CQ9NYF3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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FAM53CQ9NYF3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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FAM53CQ9NYF3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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FAM53CQ9NYF3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM53CQ9NYF3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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