Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00846Q9NV44 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms