Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPMQ9NSP4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms